Hrala sa základná a nadstavbová časť, a to turnajovým spôsobom. Základná časť pozostávala z 3 turnajov so všetkými 5 družstvami. Nadstavbová časť pokračovala ďalšími 5 turnajmi so 4 najlepšími družstvami po časti základnej.
V roku 2004 sa uskutočnil tretí ročník Slovenského pohára vo vodnom póle žien. Hral sa takisto turnajovým spôsobom a zúčastnil sa ho všetkých 5 družstiev, ktoré hrali aj v lige. Novinkou bolo odohranie semifinálového turnaja (v Piešťanoch, z ktorého najlepšie 3 tímy postúpili do finálového turnaja. Ten sa konal v Žiline od 20. – 21. novembra2004. Finálový turnaj