DNA ligáza
DNA ligáza je enzým zo skupiny ligáz, ktorý sa zúčastňuje replikácie DNA (spojovania Okazakiho fragmentov), crossing-overu a opravy DNA.[1]
Klasifikácia
[upraviť | upraviť zdroj]Existuje viacero druhov DNA ligáz, a to vo všetkých doménach života. Ako kofaktor využívajú bakteriálne DNA ligázy buď NAD+ alebo ATP. Vírusové, archebekteriálne a eukaryotické DNA ligázy využívajú, až na malé výnimky, ATP.[1] U živočíchov sú prítomné tieto DNA ligázy:
- DNA ligáza I – najvýznamnejšia[2]
- DNA ligáza II
- DNA ligáza III
- DNA ligáza IV
Nesprávna funkcia DNA ligáz môže viesť k prepuknutiu Bloomovho syndrómu alebo akútnej lymfoblastickej leukémie.
Využitie vo výskume
[upraviť | upraviť zdroj]Izolovaných už bolo veľa DNA ligáz a dnes sú neodmysliteľnou súčasťou v oblasti génového inžinierstva. Najčastejšie používaným enzýmom z tejto skupiny je T4 DNA ligáza, ktorá bola získaná z buniek E.coli infikovaných fágom T4. Optimum má síce pri 37 °C, ale najlepšie výsledky sa dosahujú pri teplotách okolo 4 – 16 °C, kedy je obmedzený tepelný pohyb molekúl DNA. Používa sa zväčša na prepojenie tzv. lepivých koncov.[3]
Referencie
[upraviť | upraviť zdroj]- ↑ a b LENNARZ, W.J:; LANE, M.D.. ENCYCLOPEDIA OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, FOUR-VOLUME SET, 1-4. [s.l.] : [s.n.]. Kapitola DNA Ligases: Mechanism and Function.
- ↑ RÉDEI, George P.. Encyclopedia of Genetics, Genomics, Proteomics, and Informatics. [s.l.] : Springer, 2008. ISBN 978-1-4020-6753-2.
- ↑ NICHOLL, Desmond S.T.. An Introduction to Genetic Engineering. [s.l.] : Cambridge University Press, 2008.