Defosfokoenzým A kináza
 Defosfo-CoA kináza z Legionella pneumophila v komplexe s ATP | |
| Identifikátory | |
|---|---|
| Číslo EC | EC 2.7.1.24 |
| Číslo CAS | 9026-83-9 |
| Databázy | |
| IntEnz | hľadať v IntEnz |
| BRENDA | hľadať v BRENDA |
| ExPASy | hľadať v ExPASy |
| KEGG | hľadať v KEGG |
| MetaCyc | hľadať v MetaCyc |
| PDB štruktúry | RSCB PDB PDBe PDBsum |
Defosfokoenzým A kináza alebo defosfoCoA kináza (DPCK alebo CoaE; EC 2.7.1.24) je enzým, ktorý katalyzuje nasledujúcu chemickú reakciu:
- ATP + defosfo-CoA ADP + CoA
Substráty tohto enzýmu sú teda ATP a defosfo-CoA, jeho produkty sú ADP a koenzým A (CoA).[1]
Klasifikácia
[upraviť | upraviť zdroj]Tento enzým patrí medzi transferázy, konkrétne tie, ktoré presúvajú skupiny obsahujúce fosfor a akceptorom je hydroxylová skupina. Systematický názov tohto enzýmu je ATP:defosfo-CoA 3'-fosfotransferáza.
Význam
[upraviť | upraviť zdroj]DPCK katalyzuje posledný krok v syntéze koenzýmu A.[2][3] Predchádzajúci krok tejto dráhy, syntézu defosfo-CoA, katalyzuje fosfopanteteínadenylyltransferáza.
Gén
[upraviť | upraviť zdroj]Tento enzým bol poprvé izolovaný z Corynebacterium ammoniogenes. Pomocou neho bola určená sekvencia, ku ktorej potom bol nájdený gén yacE u E. coli, ktorý mal vysoký stupeň homológie. Tento gén bol následne premenovaný na coaE. Na základe toho sa tento enzým niekedy označuje ako CoaE.[3]
Štruktúra
[upraviť | upraviť zdroj]DPCK pochádzajúci z E. coli je monomér s hmotnosťou 22 kDa, ktorý v prítomnosti síranových aniónov tvorí trimér v roztoku i kryštálovej štruktúre. Enzým sa skladá z troch domén: domény viažucej nukleotidy, domény viažucej substrát a „príklopnej“ domény. Predpokladá sa, že posledné dve domény sú veľmi pohyblivé a po naviazaná defosfo-CoA sa enzým „uzavrie“, čím uľahčí prenos fosfátovej skupiny.[3]
U cicavcov je PPAT spojená s defosfo-CoA kinázou do bifunkčného enzýmu, ktorý sa označuje ako CoA syntáza.[3]
Na konci roka 2023 bolo známych 24 štruktúr tohto enzýmu, s PDB kódmi 2GRJ, 4TTP, 4TTR, 1N3B, 4TTQ, 2IF2, 4I1V, 4ZO4, 8DV0, 8SBO, 8U94, 8U97, 1T3H, 4I1U, 6N39, 8SBN, 6ARI, 8U96, 1JJV, 1UF9, 1VHL, 1VIY, 2F6R a 1VHT.
Referencie
[upraviť | upraviť zdroj]- ↑ ENZYME - 2.7.1.24 dephospho-CoA kinase [online]. enzyme.expasy.org, [cit. 2023-11-29]. Dostupné online.
- ↑ MENDES, Vitor; GREEN, Simon R.; EVANS, Joanna C.. Inhibiting Mycobacterium tuberculosis CoaBC by targeting an allosteric site. Nature Communications, 2021-01-08, roč. 12, čís. 1, s. 143. Dostupné online [cit. 2023-11-29]. ISSN 2041-1723. DOI: 10.1038/s41467-020-20224-x. (po anglicky)
- ↑ a b c d LEONARDI, Roberta; JACKOWSKI, Suzanne. Biosynthesis of Pantothenic Acid and Coenzyme A. EcoSal Plus, 2007-09-13, roč. 2, čís. 2. Dostupné online [cit. 2023-11-29]. ISSN 2324-6200. DOI: 10.1128/ecosalplus.3.6.3.4. (po anglicky)
Ďalšia literatúra
[upraviť | upraviť zdroj]- Abiko Y. Pantothenic acid and coenzyme A:dephospho-CoA pyrophosphorylase and dephospho-CoA kinase as a possible bifunctional enzyme complex (ATP:pantetheine-4'-phosphate adenylyltransferase, EC 2.7.7.3 and ATP:dephospho-CoA-3'-phosphotransferase EC 2.7.1.24). Methods Enzymol., 1970, s. 358–364. DOI: 10.1016/0076-6879(71)18327-9.
- Biosynthesis of coenzyme A from phospho-pantetheine and of pantetheine from pantothenate. J. Biol. Chem., 1954, s. 767–73. PMID 13163064.
- Kinases for the synthesis of coenzyme A and triphosphopyridine nucleotide. J. Biol. Chem., 1954, s. 311–325. PMID 13130551.
Zdroj
[upraviť | upraviť zdroj]Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Dephospho-CoA kinase na anglickej Wikipédii.