Systém súťaže bol rovnaký ako v minulej sezóne. Najprv sa hrala základná časť, ktorá pozostávala zo 12 kôl, a v ktorej sa každý s každým stretol raz doma a raz vonku. Po základnej časti nasledovala nadstavbová časť, v ktorej sa družstvá rozdelili do dvoch skupín, do skupiny o 1. až 6. miesto a posledné družstvo základnej časti do prelínacej súťaže. Nadstavbová časť o prvú šesticu pozostávala z 10 kôl, v ktorej sa každý s každým doma a vonku stretol raz. Umiestnenie v tejto časti rozhodlo o najlepšej štvorici družstiev, ktoré vytvorili semifinálové dvojice play-off. Po nich nasledovali zápasy o 3. miesto a finále, ktoré určilo majstra. Družstvá na 5. až 6. mieste odohrali play-off na 2 víťazné zápasy o 5. miesto. Prelínacia súťaž, ktorú tvorilo posledné družstvo základnej časti a 4 najlepšie družstvá 1. ligy, pozostávala z 8 kôl. Družstvá sa v nej stretli každý s každým doma a vonku raz a výsledným umiestnením určili dvoch zástupcov, ktorí mohli štartovať v extralige v nasledujúcej sezóne.
Pozn.: V prvom zápase v Michalovciach pricestovali hráčky Interu Bratislava bez registračných preukazov, zápas bol preto kontumovaný v prospech Michaloviec.[4]
Sezóna 2000/01
