Systém súťaže sa oproti predchádzajúcim sezónam zmenil, zjednodušil sa. Nehrala sa ani nadstavbová časť, ani prelínacia súťaž. Najprv sa hrala štvorkolová základná časť, ktorá pozostávala z 28 kôl. Každý s každým sa stretol dvakrát doma a vonku. Po základnej časti 4 najlepšie družstvá postúpili do semifinále play-off. Všetky duely play-off sa hrali na 3 víťazné zápasy. Posledné družstvo po základnej časti zostúpilo v nasledujúcej sezóne do 1. ligy, kde ho nahradilo víťazné družstvo nižšej súťaže.[2]
↑Prešov v úvodnom kole na pôde nováčika z Bardejova [online]. sport.sme.sk, 12.06.2008, [cit. 2018-11-03]. Dostupné online.
↑ abÚradujúci šampión u nováčika, vicemajster v repríze semifinále [online]. sport.sme.sk, 04.09.2008, [cit. 2018-11-03]. Dostupné online.
↑Tatran Prešov dosiahol po 3. finálovom triumfe majstrovský hetrik [online]. zivotpo.sk, 24.05.2009, [cit. 2018-11-03]. Dostupné online.
↑Prešov obhájil triumf v základní části extraligy házenkářů, Zubří nestačilo [online]. sport.idnes.cz, 15.03.2009, [cit. 2018-11-03]. Dostupné online. (po česky)
↑V EP 2008/2009 päť klubov zo SR, bez Nových Zámkov [online]. sport.sme.sk, 19.06.2008, [cit. 2018-11-03]. Dostupné online.