V minulosti boli linky viackrát prečíslované. Prvé prečíslovanie sa udialo v roku 1944, keď linky , a dostali čísla , a . Nové linky odvtedy dostávali čísla od do . Ďalšia zmena prebehla v roku 1981, keď sa pred dovtedajšie čísla liniek pridala číslica 2, čiže z liniek , , , a sa stali linky 213, 214, 215, 217 a 218. V roku 1999 sa čísla liniek opäť menili - z 215 na , z 218 na , z 219 na a z 220 na . Nové linky vznikli zlúčením predchádzajúcich liniek: z 213 a 216 na , z 216 a 217 na , z , 213 a 216 na a z a na . Linky , a zostali nezmenené. V roku 2016 boli zmenené trasy liniek , , a a bola zrušená linka . V roku 2020 bola zrušená linka a 1. septembra2021 linka . 1. novembra2021 boli linky opäť prečíslované - z na , z na , z na , z na , z na , z na , z na , z na , z na , z na a z na .
1. novembra2021 došlo k prečíslovaniu trolejbusových liniek. Namiesto doterajších trojciferných čísel sú linky číslované jednotne s autobusovými – dvojcifernými číslami, ktorých čislice rámcovo označujú zdrojovú resp. cieľovú mestskú časť, kam linka premáva.[4][5]
Linka
Vysvetlenie nového čísla
do 1. novembra 2021
od 1. novembra 2021
oblasť
poznámka
7 - Dolné hony
zachovanie poslednej číslice
7 - Dolné hony
podľa linky ; zachovanie poslednej číslice
4 - Koliba
podľa linky
6 - Trnávka
zachovanie poslednej číslice
6 - Trnávka
princíp „na Autobusovú stanicu premávajú linky “
4 - Patrónka
podľa linky
zachovanie poslednej číslice; linka od 1. septembra nepremáva
4 - Kramáre
zachovanie poslednej číslice
princíp „na Autobusovú stanicu premávajú linky “; zachovanie poslednej číslice
4 - Kramáre, Patrónka
zachovanie poslednej číslice
4 - Prievoz
zachovanie poslednej číslice; použitie pôvodného čísla autobusovej linky, ktorú trolejbusy nahradili
Linka vznikla zatrolejovaním časti autobusovej linky s predĺžením na Jelačičovu na jednej a Lovinského na druhej strane. Zrušená bola k 1. júlu2020, nahradila ju autobusová linka , ktorá bola predĺžená až na Hlavnú stanicu. Obratisko Jelačičova tak ostalo nateraz bez využitia.
11.09.1998
04.07.2016
NÚSCH – Autobusová stanica
Linka zanikla 4. júla2016. Nahradila ju linka 209.
.svg){kind=small}
, .svg){kind=small}
a .svg){kind=small}
). Číselné označovanie bolo zavedené 1. januára 1944.
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
a .svg){kind=small}
a tromi nočnými linkami označenými .svg){kind=small}
.svg){kind=small}
a .svg){kind=small}
.
, 
a 
. Nové linky odvtedy dostávali čísla od .svg){kind=small}
. Ďalšia zmena prebehla v roku 1981, keď sa pred dovtedajšie čísla liniek pridala číslica 2, čiže z liniek 
, 
, 
a .svg){kind=small}
sa stali linky 213, 214, 215, 217 a 218. V roku 1999 sa čísla liniek opäť menili - z 215 na .svg){kind=small}
, z 218 na .svg){kind=small}
, z 219 na .svg){kind=small}
a z 220 na .svg){kind=small}
. Nové linky vznikli zlúčením predchádzajúcich liniek: z 213 a 216 na .svg){kind=small}
, z 216 a 217 na .svg){kind=small}
, z .svg){kind=small}
, 213 a 216 na .svg){kind=small}
na .svg){kind=small}
, .svg){kind=small}
a .svg){kind=small}
zostali nezmenené. V roku 2016 boli zmenené trasy liniek .svg){kind=small}
, z .svg){kind=small}
na 
.svg){kind=icon}
.svg)
Slovensko
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
“
.svg){kind=small}
s predĺžením na Jelačičovu na jednej a Lovinského na druhej strane. Zrušená bola k 1. júlu 2020, nahradila ju autobusová linka